Projektgruppen

E3.3 | DATEN- UND MODELLIERUNGSZENTRUM

Forschung an der Schnittstelle von Biodiversität und Klima hängt in besonderem Maße von der Bereitstellung und Nutzung der relevanten Daten ab. Dies erfordert nicht nur interne Strategien zu Datenhaltung, -formaten und -austausch, sondern auch die Bereitstellung von Informationen und Werkzeugen, um die wichtigen, weltweit verfügbaren Datenquellen finden und nutzen zu können. Diesem Zweck dient unser Datenportal, das ständig aktualisiert und erweitert wird.
Hier findet sich auch eine Übersicht über die wichtigsten Modelle, welche innerhalb von BiK-F verwendet werden.
Das Daten- und Modellierungszentrum stellt zum einen Infrastruktur (Hard- und Software) zur Speicherung, Standardisierung, Analyse und Verfügbarmachung von Daten bereit. Zum anderen soll durch Metadatenbanken und auch die nutzerfreundliche Aufbereitung spezifischer Daten (z.B. Klima) die wissenschaftliche Kooperation und der Datenaustausch erleichtert werden. Onlinebiodiversitätsdatenbanken wie die Flora von Frankfurt am Main und die Tropical African Plants Databases verbinden Citizen Science mit internationaler Wissenschaftsinfrastruktur wie GBIF, Map of Life und EoL. Sammlungs- und Beobachtungsbasierte Verbreitungsdaten und Inventare fließen in die Knowledge-Base Map of Life (MOL) ein, einer kooperativ mit der Universität Yale und verschiedenen anderen wissenschaftlichen und naturschutzfachlichen Institutionen entwickelten web-basierten Plattform zur Analyse und Darstellung von Verbreitungsdaten von Organismen.
Das Daten- und Modellierzentrum bildet das Bindeglied zu wichtigen BiK-F-Partnern wie DWD und EUMETSAT. Die Analyse großer Datenmengen macht die Nutzung von Hochleistungsrechnern erforderlich. Durch die Kooperation des Daten- und Modellierzentrums mit LOEWE-CSC und „Frankfurt cloud“ steht den BiK-F- Wissenschaftlern entsprechende Hardware zur Verfügung, um selbst anspruchsvollste Klima- und Vegetationsmodelle zu rechnen.

Unser Service-Angebot:

1.) Environmental drivers of biodiversity dynamics
Present and future climate data, DWD data: Brendel
Paleoclimate: Liakka
Non-climatic drivers of biodiversity dynamics: Gerstner

2.) Data collection and archiving
Data archiving: Gerstner, Weiland
Map of Life, botanical archives: Schmidt
Metacat: Gerstner

3.) Computing facilities
Massive RAM and BiK-F cluster: Weiland
Cluster Computing (LOEWE CSC): Weiland, Forrest
Frankfurt Cloud: Forrest
General IT support: Weiland

4.) Advanced statistics consulting and species distribution modeling: O’Hara

Unser Serviceangebot.

Team

Dr. Eva-Maria Gerstner, wissenschaftliche Programmierung
Dr. Matthew Forrest, Wissenschaftler
Dr. Johan Liakka, Wissenschaftler
Dr. Robert O'Hara, Wissenschaftler
Dr. Marco Schmidt, Wissenschaftler
Dr. Jana Schröder (maternity leave), Wissenschaftlerin
Dr. Claus Weiland, Wissenschaftler
Christoph Brendel, Doktorand

Publikationen

Brunken, U., Schmidt, M., Dressler, S., Janssen, T., Thiombiano, A. & G. Zizka (2008) : www.westafricanplants.senckenberg.de/ - An image-based identification tool for West African Plants. - Taxon 57 (3), 5-6.

Janßen, T., Schmidt, M., Dressler, S., Hahn, K., Hien, M., Konaté, S., Lykke, A.M., Mahamane, A., Sambou, B., Sinsin, B., Thiombiano, A., Wittig, R. & G. Zizka (2011) : Addressing data property rights concerns and providing incentives for collaborative data pooling: the West African Vegetation Database approach. - Journal of Vegetation Science 22: 614-620. 

Judith, C., Schneider, J., Schmidt, M., Ortega, R., Gaviria, J. & G. Zizka (2013) : Using high resolution remote sensing data for habitat suitability models of Bromeliaceae in the city of Mérida, Venezuela. - Landscape and Urban Planning 120: 107-118.

Liakka, J., Colleoni, F., Ahrens, B. & T. Hickler (2014) : The impact of climate-vegetation interactions on the onset of the Antarctic ice sheet. - Geophysical Research Letters 41, doi:10.1002/2013GL058994 (in press). 

Schmidt, M., Janssen, T., Dressler, S., Hahn, K., Hien, M., Konaté, S., Lykke, A.M., Mahamane, A., Sambou, B., Sinsin, B., Thiombiano, A., Wittig, R. & G. Zizka (2012) : The West African Vegetation Database. - Biodiversity and Ecology 4: 105-110.

Schmidt, M., Brunken, U., Dressler, S., Janssen, T. & G. Zizka (2008) : www.westafricanplants.senckenberg.de/ – Eine Fotodatenbank zu westafrikanischen Pflanzen. - Natur und Museum 138 (9/10), 247.

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